Образование бундеслиги. Победа в Кубке Обладателей Кубков.

В 1962 году, Немецкой Футбольной Ассоциацией, была создана Бундеслига – немецкая футбольная лига профессионального уровня. Первый турнир состоялся уже в 1963 году. Стоит отметить, что команда «Боруссия» смогла показать себя с лучшей стороны, ведь именно Тимо Конетцка – игроку это команды, удалось забить первый мяч в ворота противника. Это был первый гол за всю историю новой лиги. Первый сезон стал для клуба весьма продуктивным – он занял третье место. Однако Европейская арена не поддалась немцам, и они уехали ни с чем. Кубок Ярмарок они проиграли на второй стадии. Первый матч они «продули» со счётом 1:6, а второй – 0:4, против «Манчестера».
Первый трофей, который удалось заработать команде, после образования Бундеслиги, был кубок 1965 года. Когда разыгрывались финальные матчи Кубка Германии, Бундеслига обыграла «Алиманию Ахен» со счётом 2:0. Первый триумф на европейской арене пришёл только в 1966 году. «Боруссия» была официально признана первой командой, которая смогла одержать победу в Кубке Обладателей Кубков. Этой команде удалось избавиться от соперников с неимоверной скоростью. Сначала она выбила из турнира команду «Флориана» из Мальты, затем была «ЦСКА» из Болгарии, затем «Атлетико» из Испании и «Вест Хэм» из Англии. Финальный матч состоялся в Глазго, против «Ливерпуля». Со счётом 2:1, «Боруссия» одержала победу и стала первой командой, занявшей первое место в Кубке Обладателей Кубков.